Le tombeau du prince se trouve sous le chœur. Une petite plaque de bronze dans le sol du chœur indique la présence du tombeau. Le tombeau est accessible depuis le côté extérieur sud et il est ouvert le 1er septembre chaque année, le jour anniversaire de la mort de la princesse Eugénie. Dans la partie avant du tombeau se trouvent les cercueils en métal du couple princier, le prince Frédéric-Guillaume Constantin et la princesse Eugénie.
Le cœur de la princesse Eugénie qui a été conservée à la demande de sa mère en premier lieu dans la chapelle du Palais Leuchtenberg à Munich dans une urne est enterrée depuis 1952 dans la petite chapelle de droite à l'étage inférieur de la tour. On y trouve également une fenêtre où sont représentées la princesse pendant la prière et Sainte Elisabeth von Thüringen.
Dans la chapelle gauche se trouve l'unique représentation connue du couple princier ensemble, encadré par la devise "Tout avec Dieu, rien sans Dieu". Une autre relique de la princesse se trouve dans un ostensoir rayonnant (non exposé) en argent doré: une boucle d'oreille en or avec de véritables perles et une pierre précieuse qui appartenait à Eugénie.